Replikasi Rolling Circle

Replikasi Rolling circle. a Bakteriofag ФX174 merupakan wakil dari kelompok kecil virus yang mengenai bakteri dan eukariotik yang menyimpan informasi genetiknya pada strain tunggal (single strain). Replikasi rolling circle dapat di artikan sebagai replikasi DNA sirkuler dengan strain tunggal (+) yang akan membentuk strain pasangannya (-) yang kemudian akan saling melakukan replikasi dengan anakan tunggal (+). Menurut Gartner, ketika virus Bakteriofag ФX174 menginfeksi sel inang E.Coli, maka DNA Virus akan berupa strain tunggal (+) yang akan di ubah membentuk untai ganda (double helix) oleh syntesis strain negativ yang saling melengkapi. Peristiwa ini disebut dengan replikative form (RF). Induk strain ganda RF akan bereplikasi untuk memproduksi RF molekul (double strain) dengan melakukan replikasi secara asimetris untuk menghasilkan populasi keturunan/ anakan untai tunggal yang (+) strand. Tahap replikasi ФX174 dapat dibagi menjadi 3 tahap yaitu 1. Parental atau induk (+) strand  Induk RF (double stand)

Keterangan : a. Pengubahan dari untai tunggal (+) kromosom b. Bentuk induk untai ganda (RF) c. Sintesis yang saling melengkapi satu sama lain oleh untai negativ (-) yang diinisiasi oleh sintesis dari DNA primer pendek. Reaksi ini dikatalis oleh primase dan membutuhkan aktivitas yang kompleks dengan setidaknya 6 protein priming yang berbeda. Protein kompleks ini biasa disebut primosom. d. DNA polimerase III berikutnya mengkatalisis penmabahan kovalen dari deoxiribonukleatida ke 3’ akhir dari DNA primer. Sintesis dari komplementer strain negativ terjadi terputus-putus sampai templete positif strand habis. e. Eksisi DNA primer dan pengisian tempat kososng di katalisis oleh DNA polimerase I. Polynukleotida kemudian akan mengkatalisis

pembentukan dari kovalen antara 3’OH dan 5’PO4 Untuk menghasilkan induk RF. 2. Induk RF  Anakan RFs

Keterangan : e. Replikasi dari induk RF untuk Menghasilkan anakan/keturunan RFs f. Strand positif dari induk RF dipotong pada bagian asal oleh aktivitas endonuklease dari gen A protein ФX174. Protein induk RF tidak f-h

memotong sama sekali molekul DNA yang lain Pada tahap ini protein A menjadi terikat gugus gugus 5-fosforil dari

strain positif. g. Untai positif 5’ akhir adalah dari straind negatif deoksiribonukleotida ditambahkan sebagai lingkaran berputarnya poros. g-h Gen protein A tetap terikat pada garpu replikasi karena perputaran atau berputar di sekitar strand negatif. h-i sebanyak sekali strand positiv yang baru telah disintesis, gen dari protein A membelah yang baru lahir dan dan mensimultan 3’ dan 5’ termin untuk memproduksi kovalen strand positif. i-l sintesis dari komplemen strand negatif kemudian akan di bawa secara bertahap atau terputus-putus pada tahap penggunaan temple strand postif yang baru. i-f-l Induk RF selanjutnya secara berulang direplikasi oleh rolling circle sampai menghasilkan populasi keturunan 60 RFs. 3. Anakan RFs  Anakan (+) strand

Keterangan : l-p replikasi roling circle dari keturunan RFs terjadi hanya untuk induk RFs pada tahap 2. Kecuali pada strand negatif tidak di sintesis n-p peralihan dari sintesis tahap II untuk ketururnan strand positif yang disintesis untuk sstrand positif tahap III yang hasilnya dari pengikatan protein yang baru. q.

pematangan keturunan komplet dari siklus hidup ФX174. Sekitar

500 keturunan virion yang di hasilkan tiap sel yang terinfeksi Soal 1. Apa yang di maksud dengan replikasi rolling circle? Beri salah satu contoh tahap replikasi rooliling circle! Jawab : Replikasi rolling circle dapat di artikan sebagai replikasi DNA sirkuler dengan strain tunggal (+) yang akan membentuk strain pasangannya (-) yang kemudian akan saling melakukan replikasi dengan anakan tunggal (+). Contoh pada virus Bakteriofag ФX174 yang menginfeksi sel inang E.Coli. dalam proses replikasinya melalui tiga tahapan, yaitu :  Parental atau induk (+) strand  Induk RF (double stand)  Induk RF  Anakan RFs  Anakan RFs  Anakan (+) strand