Quimica computacional
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Quimica computacional...
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Química Cuántica I Química cuántica computacional Prof. Jesús Hernández Trujillo Facultad de Química, UNAM
ontenido Método de Hartree–Fock Propiedades moleculares Funciones base Cálculos con el programa Gaussian09
Aproximaciones: Born–Oppenheimer
Oscilador armónico
Hartree–Fock
Rotor rígido
Aproximaciones: Born–Oppenheimer
Oscilador armónico
Hartree–Fock
Rotor rígido
Para el estudio de: Energías moleculares Evolución de la estructura molecular Reactividad química y estructura electrónica Interacciones intermoleculares Espectros IR
Aproximaciones: Born–Oppenheimer
Oscilador armónico
Hartree–Fock
Rotor rígido
Para el estudio de: Energías moleculares Evolución de la estructura molecular Reactividad química y estructura electrónica Interacciones intermoleculares Espectros IR Además: Gas ideal para propiedades termodinámicas
proximación de Hartree–Fock En este caso, la función de onda es un determinante de Slater
Ψ=
1
√ N !
donde
χi (1) χi (2) .. .
χ j (1) . . . χ j (2) . . . ...
χa (1) χa (2) ...
χb (1) . . . χb (2) . . . ...
χk (1) χk (2) ...
χi (N ) χ j (N ) . . . χa (N ) χb (N ) . . . χk (N )
N : número de electrones Espín–orbitales:
χa (¯ x) = ψa (¯ r ) α(ω ) o χa (¯ x) = ψa (¯ r ) β (ω ) El conjunto χa es ortonormal
{ }
El Hamiltoniano electónico es N
−
ˆ = H
i=1
1 2
N
M
∇ − 2
i
i=1 A=1
Z A + rAi
N
N
i=1 j>i
1 rij
El Hamiltoniano electónico es N
−
ˆ = H
i=1
1 2
N
M
∇ − 2
i
i=1 A=1
Z A + rAi
N
N
i=1 j>i
1 rij
Se aplica el principio variacional para encontrar los espín orbitales que minimicen la energía
El Hamiltoniano electónico es N
−
ˆ = H
i=1
1 2
N
M
∇ − 2
i
i=1 A=1
Z A + rAi
N
N
i=1 j>i
1 rij
Se aplica el principio variacional para encontrar los espín orbitales que minimicen la energía Se introduce de una base orbital
{φµ(¯r)|µ = 1, 2, . . . , K } para expandir los orbitales moleculares (OM) K
ψi =
µ=1
cµi φµ ,
i = 1, 2, . . . , K
Se obtiene el problema de pseudo–valores propios que se resuelve iterativamente:
F C = SCε
ecuaciones de Roothaan (para capas cerradas)
donde
S : matriz de traslape r1 elementos: S ν µ = φ∗ν φµ d¯ F : matriz de Fock elementos: F ν µ =
φ∗ν f (1)φµ d¯ r1
tal que F depende de C : F = F (C )
Cálculo Hartree–Fock de la estructura molecular de mínima energía (optimización de geometría): coords, carga, multiplicidad, base orbital, etc OM iniciales (ej: Hückel) procedimiento SCF: FC=SCε
nuevos OM
¿SCF convergido?
∇E → nueva geometría ¿geometría convergida? salida: geometría final y propiedades
ropiedades moleculares Densidad electrónica.
ρ(¯ r) = N
· · · |
Ψ(¯ x1 , x ¯2 , . . . , x ¯N ) 2 dω1 dx ¯2 . . . dx ¯N
|
ropiedades moleculares Densidad electrónica.
ρ(¯ r) = N
· · · |
Ψ(¯ x1 , x ¯2 , . . . , x ¯N ) 2 dω1 dx ¯2 . . . dx ¯N
|
En la aproximación de Hartree–Fock: N/2
ρ(¯ r) = 2
|
ψa (¯ r)
a
tal que
ρ(¯ r)d¯ r = N
2
|
suma sobre orbitales ocupados
Momento dipolar N
µ ¯ =
− Ψ∗
¯ ri
M
Ψdx ¯ 1 dx ¯ 2 . . . dx ¯N +
A
i
M
=
r¯ρ(¯ r )dr¯ +
A
¯A Z A R
¯A Z A R
Potencial electrostático V (¯ r) =
η (¯ r′ )
|¯r − ¯r| ′
d¯ r′
r) = ρ(¯ r) + contrib nuρtot (¯ clear
Potencial electrostático V (¯ r) =
η (¯ r′ )
|¯r − ¯r| ′
d¯ r′
r) = ρ(¯ r) + contrib nuρtot (¯ clear
Potencial electrostático V (¯ r) =
η (¯ r′ )
|¯r − ¯r| ′
d¯ r′
r) = ρ(¯ r) + contrib nuρtot (¯ clear
Cuando una molécula A interactúa con otra B , la energía electrostática es E el =
V A (¯ r) ηB (¯ r) d¯ r
Cargas atómicas. En términos de las funciones base K
ρ(¯ r) =
µ
K
N =
N/2
K
P µν φν (¯ r)φµ (¯ r) ,
P µν = 2
ν
K
P µν S ν µ =
µ
∗
ν
donde D = P S
a
K
K
(P S )µµ =
µ
µ
Dµµ
∗ C µa C νa
Cargas atómicas. En términos de las funciones base K
ρ(¯ r) =
µ
K
N =
N/2
K
∗
P µν φν (¯ r)φµ (¯ r) ,
ν
a
K
P µν S ν µ =
µ
P µν = 2
ν
K
K
(P S )µµ =
µ
donde D = P S
Carga del átomo A (Mulliken): K
qA = Z A
−
µ∈A
Dµµ
µ
Dµµ
∗ C µa C νa
Cargas atómicas. En términos de las funciones base K
ρ(¯ r) =
µ
K
N =
N/2
K
∗
P µν φν (¯ r)φµ (¯ r) ,
ν
∗ C µa C νa
a
K
P µν S ν µ =
µ
P µν = 2
ν
K
K
(P S )µµ =
µ
donde D = P S
Dµµ
µ
Carga del átomo A (Mulliken): K
qA = Z A
−
µ∈A
Dµµ D=
D11 D21 D31 .. .
D12 D22 D32
D13 D23 D33
DK 1 DK 2 DK 3
··· ··· ···
D1K D2K D1K ...
···
DKK
..
.
unciones base Un conjunto de funciones base debe ser tal que requiera el menor número de términos Usualmente consiste en combinaciones lineales (contracciones) de funciones Gaussianas de la forma L
φµ (¯ r donde
− R ¯ A) =
p=1
d pµ g p (α pµ , r¯
− R ¯ A)
{R A} es el conjunto de coordenadas nucleares. ¯ A ) se Las funciones Gaussianas g p (α pµ , r¯ − R llaman funciones primitivas Las constantes d pµ se llaman coeficientes de contracción
Ejemplos de funciones primitivas normalizadas: 3 1/4
3
φ1s (α, r¯) = (8α /π )
−αr
e
3 1/ 4
5
φ2 px (α, r¯) = (128α /π ) 7
−αr
xe
3 1/ 4
φ3dxy (α, r¯) = (2048α /π )
2
xy e
2
−αr
2
Ejemplos de funciones primitivas normalizadas: 3 1/4
3
φ1s (α, r¯) = (8α /π )
−αr
e
3 1/ 4
5
φ2 px (α, r¯) = (128α /π ) 7
−αr
xe
3 1/ 4
φ3dxy (α, r¯) = (2048α /π )
2
xy e
2
−αr
2
El uso de funciones Gaussianas disminuye el costo computacional en relación a las funciones tipo Slater
Ejemplos de funciones primitivas normalizadas: 3 1/4
3
φ1s (α, r¯) = (8α /π )
−αr
e
3 1/ 4
5
φ2 px (α, r¯) = (128α /π ) 7
−αr
xe
3 1/ 4
φ3dxy (α, r¯) = (2048α /π )
2
xy e
2
−αr
2
El uso de funciones Gaussianas disminuye el costo computacional en relación a las funciones tipo Slater Los conjuntos d pµ y α pµ se ajustan mediante algún criterio.
{ } {
}
Ejemplos: para reproducir orbitales tipo slater ։ para minimizar la energía en cálculos atómicos ։
Ejemplos de funciones base Base mínima: STO–LG Contienen
el mínimo número de funciones por átomo para describir los orbitales atómicos ocupados. L es el número de funciones Gaussianas contraídas. Ejemplo:
0.6
Ψ1s
STO−1G STO−2G STO−3G
0.5 0.4 0.3 0.2 0.1 0 0
1
2
3
4
5
Ejemplos de funciones base Base mínima: STO–LG Contienen
el mínimo número de funciones por átomo para describir los orbitales atómicos ocupados. L es el número de funciones Gaussianas contraídas. Ejemplo:
0.6
Ψ1s
STO−1G STO−2G STO−3G
0.5 0.4 0.3 0.2
¿Cuántas funciones primitivas y funciones base hay para un átomo C en la base STO–3G?
0.1 0 0
1
2
3
4
5
Base doble Zeta: 6–31G Estas
bases proporcionan mayor
flexibilidad de cálculo. En la base 6–31G:
átomo H 3
φ′1s =
d′i,1s g1s (α′i,1s )
i=1
φ′′ = g1s (α′′ ) 1s 1s
Base doble Zeta: 6–31G Estas
bases proporcionan mayor
flexibilidad de cálculo. En la base 6–31G:
átomo H 3
φ′1s =
d′i,1s g1s (α′i,1s )
i=1
φ′′ = g1s (α′′ ) 1s 1s
átomos de Li a F φ1s =
6
3
di,1s g1s (αi,1s )
i=1
d′i,2 p g2 p (α′i,2sp )
i=1
3
φ′2s =
φ′2 p =
d′i,2s g2s (α′i,2sp )
i=1
φ′′ = g2s (α′′ ) 2s 2sp
φ′′ = g2 p (α′′ ) 2 p 2sp
Base doble Zeta: 6–31G Estas
bases proporcionan mayor
flexibilidad de cálculo. En la base 6–31G:
átomo H 3
φ′1s =
d′i,1s g1s (α′i,1s )
i=1
φ′′ = g1s (α′′ ) 1s 1s
átomos de Li a F φ1s =
6
3
di,1s g1s (αi,1s )
i=1
d′i,2 p g2 p (α′i,2sp )
i=1
3
φ′2s =
φ′2 p =
d′i,2s g2s (α′i,2sp )
i=1
φ′′ = g2s (α′′ ) 2s 2sp
φ′′ = g2 p (α′′ ) 2 p 2sp
¿Cuántas funciones primitivas y funciones base hay para esos átomos en la base 6–31G?
Bases doble Zeta polarizadas: Generalmente
constituyen el siguiente paso antes de usar bases triple Z. Por ejemplo
p o de mayor momento angular para H d o mayor para atomos de Li a F
Bases doble Zeta polarizadas: Generalmente
constituyen el siguiente paso antes de usar bases triple Z. Por ejemplo
p o de mayor momento angular para H d o mayor para atomos de Li a F ¿Cuántas funciones primitivas y funciones base para H y C hay en la base 6-31G**?
Bases doble Zeta polarizadas: Generalmente
constituyen el siguiente paso antes de usar bases triple Z. Por ejemplo
p o de mayor momento angular para H d o mayor para atomos de Li a F ¿Cuántas funciones primitivas y funciones base para H y C hay en la base 6-31G**?
álculos con el programa Gaussian09 Generación de archivo de texto ARCH.gjf
#p hf/3-21g guess=huckel opt
Método de cálculo
Optimización de geometría de trans–difluoro etileno
Descripción de la corrida
o B3LYP
01 C H C H F F
Carga y multiplicidad de la molécula
-5.47709921 -0.19083969 0.00000000 -4.94393547 -1.11854461 0.00000000 -4.80182490 0.98413761 0.00000000 -5.33498865 1.91184253 -0.00000000 -3.45182490 0.98413761 0.00000000 -6.82709921 -0.19083969 0.00000000
coordenadas atómicas
Además: Frecuencias vibracionales + análisis termoquímico: freq, opt freq
Además: Frecuencias vibracionales + análisis termoquímico: freq, opt freq Perfil energético Búsqueda de estado de transición: opt=ts Coordenada de reacción: irc=(forward,calcfc), irc=(reverse,calcfc)
Además: Frecuencias vibracionales + análisis termoquímico: freq, opt freq Perfil energético Búsqueda de estado de transición: opt=ts Coordenada de reacción: irc=(forward,calcfc), irc=(reverse,calcfc) Ver: http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/l_keywords09.htm
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