Microbiologia (versão impressão)

Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa 

 

Mestrado Integrado em Medicina 

 

Tronco Comum II  Mestrado Integrado em Medicina 

 

Microbiologia   

 

     

2º Ano       

 

 

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Tronco Comum II ‐ Microbiologia 

       

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Índice  ÍNDICE ................................................................................................................... 3  RELAÇÕES HOSPEDEIRO‐PARASITA ............................................................................... 7  MORFOLOGIA BACTERIANA ...................................................................................... 10  GENÉTICA BACTERIANA ............................................................................................ 15  ANTIBIÓTICOS ....................................................................................................... 19  PROPRIEDADES DOS VÍRUS ....................................................................................... 26  PROPRIEDADES DOS FUNGOS .................................................................................... 39  PROPRIEDADES DOS PARASITAS ................................................................................. 42  BACTERIOLOGIA .......................................................................................... 45  MECANISMOS ENVOLVIDOS NA PATOGENIA BACTERIANA ................................................ 46  STAPHYLOCOCCUS .................................................................................................. 48  STREPTOCOCCUS .................................................................................................... 57  Streptococcus pyogenes (Grupo A) ...................................................................................... 57  Streptococcus agalactiae (Grupo B) .................................................................................... 63  Streptococcus pneumoniae .................................................................................................. 65  ENTEROCOCCUS ..................................................................................................... 69  BACILLUS .............................................................................................................. 72  Bacillus anthracis ................................................................................................................. 72  Bacillus cereus e outras Espécies ......................................................................................... 74  NEISSERIA ............................................................................................................ 77  Neisseria gonorrhoeae ......................................................................................................... 77  Neisseria meningitidis .......................................................................................................... 81  Meningococcemia ................................................................................................................ 83  ENTEROBACTERIACEAE ............................................................................................. 85  Escherichia coli ..................................................................................................................... 87  Salmonella ........................................................................................................................... 89  Shigella ................................................................................................................................ 91  Yersinia ................................................................................................................................ 91  Klebsiella .............................................................................................................................. 93  Proteus ................................................................................................................................. 93  VIBRIO................................................................................................................. 95  BORDETELLA ......................................................................................................... 98  CORYNEBACTERIUM .............................................................................................. 102  Corynebacterium diphtheriae ............................................................................................ 102  PASTEURELLACEAE ................................................................................................ 106  Haemophilus ...................................................................................................................... 106  CAMPYLOBACTER E HELICOBACTER ........................................................................... 111  Campylobacter ................................................................................................................... 111  Helicobacter ....................................................................................................................... 115  PSEUDOMONAS ................................................................................................... 119  Moraxella ........................................................................................................................... 124  ESPIROQUETÍDIOS ................................................................................................ 125  Treponema ......................................................................................................................... 125  Borrelia .............................................................................................................................. 129  Leptospira .......................................................................................................................... 132  LEGIONELLA ........................................................................................................ 136  MYCOPLASMA E UREAPLASMA ................................................................................ 140  RICKETTSIA, ORIENTIA, EHRLICHIA E COXIELLA ............................................................. 144  Rickettsia rickettsii ............................................................................................................. 144  Rickettsia prowazekii ......................................................................................................... 146  Página 3 de 381  Mestrado Integrado em Medicina – 2º Ano 

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Rickettsia typhi .................................................................................................................. 147  Orientia tsutsugamushi ..................................................................................................... 148  Ehrlichia ............................................................................................................................. 148  Coxiella burnetti ................................................................................................................. 150 

CHLAMYDIACEAE .................................................................................................. 152  Chlamydia trachomatis ...................................................................................................... 153  Chlamydophila pneumoniae .............................................................................................. 157  Chlamydophila psittaci ...................................................................................................... 158  CLOSTRIDIUM ...................................................................................................... 159  Clostridium perfringens ..................................................................................................... 159  Clostridium tetani .............................................................................................................. 161  Clostridium botulinum ....................................................................................................... 163  Clostridium difficile ............................................................................................................ 166  BACILOS GRAM‐NEGATIVOS ANAERÓBIOS.................................................................. 167  COCOS GRAM‐POSITIVOS ANAERÓBIOS ..................................................................... 170  BACILOS NÃO‐FORMADORES  DE ESPOROS ................................................................. 170  Cocos Gram‐Positivos Anaeróbios ..................................................................................... 170  Bacilos Gram‐Positivos, Anaeróbios, Não Esporulados ..................................................... 170  Actinomyces ....................................................................................................................... 171  Proprionibacterium ............................................................................................................ 172  Mobiluncus ........................................................................................................................ 173  Lactobacillus ...................................................................................................................... 173  Bifidobacterium e Eubacterium ......................................................................................... 173  MYCOBACTERIUM ................................................................................................ 174  Mycobacterium tuberculosis ............................................................................................. 175  Mycobacterium leprae ....................................................................................................... 176  Complexo Mycobacterium avium ...................................................................................... 176  Outras Micobactérias de Crescimento Lento ..................................................................... 177  Micobactérias de Crescimento Rápido .............................................................................. 177  VIROLOGIA ................................................................................................ 181  MECANISMOS DA PATOGENIA VIRAL ......................................................................... 182  AGENTES ANTI‐VIRAIS ........................................................................................... 189  PAPOVÍRUS ......................................................................................................... 191  Papilomavírus Humano ..................................................................................................... 191  Poliomavírus ...................................................................................................................... 193  ADENOVÍRUS ...................................................................................................... 196  HERPESVÍRUS HUMANOS ....................................................................................... 200  Vírus do Herpes Simples ..................................................................................................... 201  Vírus Varicela‐Zoster .......................................................................................................... 204  Vírus Epstein‐Barr .............................................................................................................. 207  Citomegalovírus ................................................................................................................. 210  Herpesvírus Humanos 6 e 7 ............................................................................................... 212  Herpesvírus Humano 8....................................................................................................... 213  POXVÍRUS .......................................................................................................... 214  PARVOVÍRUS ....................................................................................................... 217  PICORNAVÍRUS .................................................................................................... 220  Enterovírus ......................................................................................................................... 222  Rinovírus ............................................................................................................................ 224  CORONAVÍRUS ..................................................................................................... 227  PARAMIXOVÍRUS .................................................................................................. 229  Vírus do Sarampo............................................................................................................... 230  Vírus da Parainfluenza ....................................................................................................... 232  Vírus da Papeira ................................................................................................................. 233  Vírus Sincicial Respiratório ................................................................................................. 234  Vírus Nipah e Hendra ......................................................................................................... 235  Página 4 de 381  Mestrado Integrado em Medicina – 2º Ano 

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ORTOMIXOVÍRUS ................................................................................................. 236  REOVÍRUS .......................................................................................................... 240  Ortorreovírus (Reovírus de Mamíferos) ............................................................................. 242  Rotavírus ............................................................................................................................ 243  Coltivírus e Orbivírus .......................................................................................................... 245  RABDOVÍRUS ....................................................................................................... 247  TOGAVÍRUS E FLAVIVÍRUS ....................................................................................... 251  Alphavírus e Flavivírus ....................................................................................................... 251  Vírus da Rubéola ................................................................................................................ 254  RETROVÍRUS ....................................................................................................... 257  Vírus da Imunodeficiência Humana ................................................................................... 261  VÍRUS DA HEPATITE .............................................................................................. 266  Vírus da Hepatite A ............................................................................................................ 266  Vírus da Hepatite B ............................................................................................................ 268  Vírus das Hepatites C e G ................................................................................................... 273  Vírus da Hepatite D ............................................................................................................ 275  Vírus da Hepatite E ............................................................................................................ 276  VÍRUS LENTOS NÃO‐CONVENCIONAIS: PRIÕES ............................................................ 277  MICOLOGIA ............................................................................................... 280  MECANISMO DE PATOGENICIDADE DOS FUNGOS ......................................................... 281  AGENTES ANTI‐FÚNGICOS ...................................................................................... 284  DIAGNÓSTICO LABORATORIAL DAS DOENÇAS FÚNGICAS ................................................ 287  MICOSES SUPERFICIAIS, CUTÂNEAS E SUBCUTÂNEAS ..................................................... 289  Micoses Superficiais ........................................................................................................... 289  Micoses Cutâneas .............................................................................................................. 290  Micoses Subcutâneas ......................................................................................................... 292  MICOSES SISTÉMICAS ............................................................................................ 295  Histoplasmose.................................................................................................................... 295  Blastomicose ...................................................................................................................... 297  Paracoccidioidomicose ...................................................................................................... 298  Coccidioidomicose ............................................................................................................. 299  Criptococose ...................................................................................................................... 301  MICOSES OPORTUNISTAS ....................................................................................... 303  Candidíase ......................................................................................................................... 303  Aspergilose ........................................................................................................................ 305  Zigomicose ......................................................................................................................... 306  Pneumocystis carinii .......................................................................................................... 308  Peniciloses por Penicillium marnefeii ................................................................................. 309  PARASITOLOGIA ........................................................................................ 311  PATOGENIA DAS DOENÇAS PARASITÁRIAS .................................................................. 312  PROTOZOÁRIOS INTESTINAIS E UROGENITAIS .............................................................. 314  Amibas ............................................................................................................................... 314  Flagelados .......................................................................................................................... 317  Ciliados .............................................................................................................................. 321  Coccídeos ........................................................................................................................... 322  Microsporídeos .................................................................................................................. 326  PROTOZOÁRIOS DO SANGUE E DOS TECIDOS ............................................................... 328  Espécies de Plasmodium .................................................................................................... 328  Espécies de Babesia ........................................................................................................... 333  Toxoplasma gondii ............................................................................................................. 334  Leishmania ......................................................................................................................... 336  Tripanossomas ................................................................................................................... 339  NEMÁTODES ....................................................................................................... 345  Enterobius vermicularis ..................................................................................................... 345  Ascaris lumbricoides .......................................................................................................... 346  Página 5 de 381  Mestrado Integrado em Medicina – 2º Ano 

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Toxocara canis e Toxocara e cati ....................................................................................... 348  Trichuris trichiura ............................................................................................................... 349  Ancilóstomos ..................................................................................................................... 350  Strongyloides stercoralis .................................................................................................... 352  Trichinella spiralis .............................................................................................................. 354  Wuchereria bancrofti e Burgia malayi ............................................................................... 356  Loa loa ............................................................................................................................... 357  Onchocerca volvulus .......................................................................................................... 358  Dirofilaria immitis .............................................................................................................. 360  Dracunculus medinensis .................................................................................................... 360 

TREMÁTODES ...................................................................................................... 362  Fasciolopsis buski ............................................................................................................... 362  Fasciola hepatica ............................................................................................................... 363  Opisthorchis sinensis .......................................................................................................... 365  Paragoninus westermani ................................................................................................... 366  Esquistossomas .................................................................................................................. 367  Dermatite por Cercária ...................................................................................................... 371  CÉSTODES ........................................................................................................... 373  Taenia solium ..................................................................................................................... 373  Cisticercose ........................................................................................................................ 374  Taenia saginata ................................................................................................................. 375  Diphylobothrium latum...................................................................................................... 376  Echinococcus granulosus ................................................................................................... 378  Hymenolepis nana ............................................................................................................. 379  Dipylidium caninum ........................................................................................................... 380 

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Relações Hospedeiro‐Parasita  Flora  Indígena  –  constitui  o  conjunto  de  células  que  não  pertencem  ao  nosso  organismo, ou seja todos os microrganismos que co‐habitam no nosso organismo. Apenas 10%  das células existentes no nosso organismo são humanas, as restantes 90% são microrganismos.    Todo  o  ser  humano  nasce  estéril,  no  entanto  logo  no  momento  do  parto,  ao  tomar  contacto  com  o  ambiente  exterior,  é  colonizado  por  um  número  incontável  de  microrganismos, sendo que muitos deles o acompanharam durante toda a sua vida.    Microrganismo  Residente  –  é  o  microrganismo  que  é  capaz  de  se  multiplicar  nas  condições do local onde está alojado;    Microrganismos  Transitórios  –  é  aquele  que  não  sendo  capaz  de  se  dividir  no  local  onde habita se vê obrigado a migrar para outro local que lhe seja mais favorável ou acaba por  ser extinto;    Colonização  –  aquisição  de  microrganismos,  que  podem  não  provocar  qualquer  lesão/dano ou, pelo contrário, perturbar o normal funcionamento de um tecido ou órgão, de  forma mais, ou menos, intensa, induzindo uma resposta imunitária por parte do hospedeiro.  Esta  tem  em  vista  a  eliminação  do  microrganismo,  podendo,  no  entanto,  também  o  microrganismo ficar retido/latente no organismo;    Latência – estado em que um microrganismo permanece no nosso organismo sem que  o consigamos eliminar;    Comensalismo ‐ associação simbiótica em que um microrganismo usa o corpo de uma  espécie de maior porte como seu ambiente físico, podendo usar esse mesmo ambiente para  adquirir nutrientes. Para além disso, o microrganismo não provoca lesão no hospedeiro, ou a  lesão  é  de  tal  modo  leve  que  não  tem  tradução  clínica,  ou  seja,  a  lesão  é  clinicamente  inaparente.  Os  microrganismos  comensais  podem  inclusive  beneficiar  o  hospedeiro,  prevenindo  a  colonização  de  dada  área  por  espécies  mais  patogénicas  ou  produzindo  metabolitos  passíveis  de  serem  usados  por  ele.  No  entanto,  estes  microrganismos  podem  tornar‐se  prejudiciais  se  as  suas  condições  ambientais  forem  perturbadas.  É  este  tipo  de  relação que a maioria da flora indígena estabelece no organismo;    Hospedeiro  Definitivo  –  define‐se  pelo  hospedeiro  em  que  o  microrganismo  desenvolve a sua forma adulta e completa a sua reprodução sexuada; 

  Hospedeiro  Intermediário  –  define‐se  pelo  hospedeiro  em  que  o  microrganismo  se  encontra num estado intermédio e se reproduz de forma assexuada.   

Acção Patogénica    Infecção – aquisição de microrganismos exógenos e sua posterior multiplicação;    Infecção  Endógena  –  quebra  do  equilíbrio  existente  entre  a  flora  indígena  e  o  organismo, o que leva a uma multiplicação descontrolada desses microrganismos e invasão de  territórios dantes não colonizados;    Página 7 de 381  Mestrado Integrado em Medicina – 2º Ano 

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Doenças Infecciosas – não são mais do que as manifestações das infecções;    Lesão  –  consiste  na  interrupção  da  estrutura  ou  função  de  uma  determinada  célula,  tecido ou órgão;    Agente Patogénico – é um microrganismo capaz de causar lesão;    Patogenicidade  –  baseia‐se  na  capacidade  de  causar  patologia,  ou  seja,  se  um  microrganismo é capaz de lesar ou não o organismo;    Virulência – relaciona‐se com a intensidade com que é demonstrada a patogenidade  de um determinado microrganismo;    Factor  de  Virulência  –  entende‐se  pelo  componente  microbiano  que  vai  ser  patogénico e por isso causar lesão no hospedeiro;   

Virulência    A virulência é um processo que pode ser dividido em diversas fases:  1. Aderência    Colonização,  ou  seja,  a  ligação  a  receptores  e  a  estruturas  que  podem ser especificas ou inespecíficas;  2. Invasão    Penetração,  Progressão  e  Multiplicação,  o  que  implica  penetrar  as  barreiras  anatómicas,  inibir  ou  neutralizar  os  mecanismos  humorais  de  defesa  e  por fim inactivar os mecanismos celulares de defesa;  3. Produção  de  Toxinas    Exotoxinas,  sendo  estas  libertadas  por  exocitose,  mantendo‐se o microrganismo vivo, a sua libertação implica a lise celular;  4. Fuga aos Mecanismos de Defesa  esta pode ser consiga através da localização  privilegiada,  por,  mimetismo  antigénico,  revestimento  com  moléculas  do  hospedeiro, tolerância imunológica, variação antigénica e imunossupressão;    Mimetismo Antigénico – consiste na produção e apresentação de antigénios idênticos  aos do organismo hospedeiro para que seja reconhecido como uma célula endógena;    

Origem da Infecção    No  caso  de  ser  uma  infecção  endógena,  não  se  inclui  a  porta  de  entrada,  pois  o  microrganismo  já  se  encontra  dentro  do  hospedeiro.  No  entanto  numa  infecção  exógena  podemos distinguir as características:   Porta de Entrada   Reservatório, não é mais do que o local onde este se encontra armazenado;   Vector, não é mais do que o meio pelo qual é transportado;   Transmissão,  que  poderá  ser  horizontal,  caso  ocorra  em  indivíduos  da  mesma  geração, ou vertical, caso ocorra do progenitor para a descendência;   Porta de Saída   

Transmissão    Existem diversos modos de transmissão e estão muitas vezes relacionados com a porta  de entrada/saída:  1. Oral‐Oral (Porta de Saída:Boca /Porta de Entrada: Boca)  2. Fecal‐Oral (Porta de Saída: Ânus/Porta de Entrada: Boca)  Página 8 de 381  Mestrado Integrado em Medicina – 2º Ano 

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Sexual (Porta de Saída: Aparelho Genital/Porta de Entrada: Aparelho Genital)  Vector (não há transmissão entre humanos)  Zoonose s/ vector (não há transmissão directa entre humanos)  Zoonose c/ vector (não transmissão directa) 

    Controlo da Transmissão    Fecal – Oral: através do saneamento básico, da disponibilização de água potável e da  regra de lavar as mãos;  Sexual: uso de uma barreira física (ex. preservativo) e uma redução da promiscuidade;  Zoonoses: controlo da infecção animal e controlo dos vectores;  Respiratório: não é controlável;     

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Morfologia Bacteriana  Os microrganismos podem estar dividimos consoante a sua organização estrutural em:  Procariotas –  possuem um cromossoma único e circular, menos quantidade  de  DNA,  são geralmente haplóides e não possuem núcleo nem organitos membranares;  Eucariotas  –  têm  cromossomas  lineares,  maior  quantidade  de  DNA,  são  geralmente  diplóides, e possuem núcleo com invólucro nuclear e organitos membranares;    Características  Eucariotas  Procariotas  Algas, Protozoários, Plantas e  Principais Grupos  Bactérias  Animais  Tamanho  0,5 – 3 mm  > 5 mm  Estrutura do Núcleo      Núcleo  Membrana Nuclear Clássica  Ausente  Cadeias de DNA Linear  DNA Único e Circular  Cromossoma  Genoma Diplóide  Genoma Haplóide  Estrutura do Citoplasma      Mitocôndrias  Presente  Ausente  Aparelho do Golgi  Presente  Ausente  Retículo Endoplasmático  Presente  Ausente  Ribossomas  80S (60S + 40S)  70S (50S + 30S)  Membrana Citoplasmática  Contem Esteróides  Não Contém Esteróides  Estrutura complexa formada  Parede Celular  Ausente  por proteínas, lípidos e  peptidoglicano  Reprodução  Sexual e Assexuada  Assexuada (Bipartição)  Flagelos com Complexos  Flagelos Simples  Movimento  Ausentes  Ausentes  Através da Membrana  Respiração  Via Mitocondrial  Citoplasmática    É  importante  ter  uma  noção  do  tamanho  em  microbiologia  e  para  isso  usamos  uma  escala de valores generalizados:  Macrófago  10 – 20 µm  Bactéria  0,5 – 2 µm  Vírus 