I Parcijala

Sta je predstavljeno na slici.Objasni strukturne karakteristike predstavljene molekule:

Mioglobin je kompaktna mol.dimenzija 4,5x3,5x,5nm.!5" lanca je u obliku # al$a %elixni% segmenata&oznaceni slovima od ' do ().*zmedju %eliksa nalazi se 5 ne%eliksni% segmenatakoji povezuju %elikse &oznaceni su kao '+,-,/...itd) '+,-,/...itd) i jos  ne%eliksna regiona na 0 i  terminusu& ak na 0 i 5 ak na .).1 unutrasnjosti se nalaze nepolarni ostaci i   polarna ostatka %istidina.(em je smjesten u dzepu koji najvecim dijelom grade  i / %eliksi.Molekula mioglobina se sastoji iz 2 polipeptidnog lanca.Strukturni motiv u koji je svijen polipeptidni lanac mioglobina nazvan je globinsko nabiranje i karakter.je za molekule  prenosioce kisika,omogujuci %emu da reverzibilno vezuje vezuje kisik.(em se sastoji iz  protopor$irina  na koji je vezan jos zeljeza u /ero oksidacijskom stanju&).or$irinski  prsten sastoji se od 4 pirolova prstena koji su povezani povezani metilskim mostovima,na pirolove  prstenove kao bocni lanci vezani su  ostatska propionske propionske kiseline, vinilne i 4 metilne grupe.Ovo /e moze graditi 6 koordinativne veze....&str ana 6 praktikum)

Šta je predstavljeno na slici ?

Na slici je prikazan MHC 1 protein.MHC proteini proteini klase 1 imaju nevarijabilni B lanac (B2 mikrolobulini! mikrolobulini! i varijabilni "#lanac .$ba su smjestena e%tracelularno.&vaki covjek stvara ' razliciti " lanaca za klasu 1 MHC proteina.)naci da B lanac ne ucestvuje u *ormiranju ipervarijabilno ipervarijabilno reiona odnosno mjesta za vezivanje antiena. MHC 1 proteini nalaze se na povrsini celija kicmenjaka .+ada stvori stvori peptid dospije u cistol cistol , oni se kombiniraju kombiniraju sa proteinom MHC1 te kao takvi vezu se sa vanjske vanjske strane celijske membrane kao sinali za kaskadni proces .

Napisi rakciju rakciju alanin aminotrans*eraze .+oji .+oji koenzim koenzim ucestvuje u reakciji?$bjasni njeovu ulou ? Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin aminotrans*eraze odvija se uz pomoc koenzima koenzima piridoksal *os*ata . -ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezan za enzim , stvaraju stvaraju  bazu .Mezo.......... .Mezo.......... , pomakom pomakom dvostruke dvostruke veze i idrolizom dolazi do izdvajanja 2 okso kiseline , a piridoksal piridoksal *os*at ostaje vezan za enzim.-iridoksalni enzim.-iridoksalni *os*at dalje reauje reauje sa "#oksolutaratom dajuci  bazu. bazu. Nakon Nakon pomaka dvostruke dvostruke veze idrolizom idrolizom se oslobadja lutamat . Šta je predstavljeno predstavljeno na dijaramu ? $bjasni promjenu kineticki parametara na datoj slici . /ijaram predstavlja predstavlja enzimsku kinetiku u prisustvu i bez kompetitivno kompetitivno inibitora . Moze se konstatovati da ezivanje kompetitivno kompetitivno inibitora na aktivno mjesto u enzimu umjesto supstrata dovodi do promjene Micaellsove konstante koja koja predstavlja predstavlja odnos supstrata i enzima ( ako je k0 k2! k2! jacine njiovo vezivanja vezivanja kao i njiovo aniteta , sto je kM kM manje to se supstrat labavije veze i ima manje aniteta .3 kompetitivnoj kompetitivnoj inibiciji kM se povecava , 4ma% ostaje nepromjenjeno .)nacajka ovo vida inibicije jeste sto se moze moze sprijeciti koncentracijama koncentracijama supstrata. 154 6 +m 54ma% 7 15Cs 8 15 4ma% 7

1 5+m odsjecak na apcisu

Napisi rakciju rakciju alanin aminotrans*eraze .+oji .+oji koenzim koenzim ucestvuje u reakciji?$bjasni njeovu ulou ? Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin aminotrans*eraze odvija se uz pomoc koenzima koenzima piridoksal *os*ata . -ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezan za enzim , stvaraju stvaraju  bazu .Mezo.......... .Mezo.......... , pomakom pomakom dvostruke dvostruke veze i idrolizom dolazi do izdvajanja 2 okso kiseline , a piridoksal piridoksal *os*at ostaje vezan za enzim.-iridoksalni enzim.-iridoksalni *os*at dalje reauje reauje sa "#oksolutaratom dajuci  bazu. bazu. Nakon Nakon pomaka dvostruke dvostruke veze idrolizom idrolizom se oslobadja lutamat . Šta je predstavljeno predstavljeno na dijaramu ? $bjasni promjenu kineticki parametara na datoj slici . /ijaram predstavlja predstavlja enzimsku kinetiku u prisustvu i bez kompetitivno kompetitivno inibitora . Moze se konstatovati da ezivanje kompetitivno kompetitivno inibitora na aktivno mjesto u enzimu umjesto supstrata dovodi do promjene Micaellsove konstante koja koja predstavlja predstavlja odnos supstrata i enzima ( ako je k0 k2! k2! jacine njiovo vezivanja vezivanja kao i njiovo aniteta , sto je kM kM manje to se supstrat labavije veze i ima manje aniteta .3 kompetitivnoj kompetitivnoj inibiciji kM se povecava , 4ma% ostaje nepromjenjeno .)nacajka ovo vida inibicije jeste sto se moze moze sprijeciti koncentracijama koncentracijama supstrata. 154 6 +m 54ma% 7 15Cs 8 15 4ma% 7

1 5+m odsjecak na apcisu

$bjasni sta je je prikazano prikazano na slici i obiljezi pojmove na predvidjenim predvidjenim mjestima na slici. Na slici je prikazan prostorni prostorni raspored kljucni aminokiselinski ostataka oko ema miolobina.$2 miolobina .$2 idroenskom vezom povezan oksitalni istidin .9unkcija .9unkcija prostetske upe modelirana  je njenom okolinom.4 okolinom.4ezivanja ezivanja $2 za em ovisi i od molekularno molekularno kretanja , osnosno disanja proteinske proteinske strukture .Model miolobinsko miolobinsko vezivno mjesta za kisik pokazuje em, proksimalni proksimalni istidin (9:! i distalni istidin (; d!povecava 4ma% e!povecava 4ma% i povecava +m

@1.+oji se od nabrojani enzima reulira primarno alosterickom interakcijom? a! ne vidi se i tacno je pod a b!piruvat deidroenaza c!likoen *os*orilaza d!likoen sintaza e!spartat transkarbamilaza

@2.3loa distalno istidina u miolobinu je J a(poo+ u odrzavanju 8. u "ero stanju b!&prijecavanje cvrsto vezanja C$2 c!4ezanje za petu koordinativnu poziciju 9e d(sprije+avanje +vrstog vezanja CO e(vezanje O2

@0.+oja od sljedeci tvrdnji je tacna? a!+riva saturacije oksienom za miolobin ima oblik simoide a za emolobin iperbole .(a:nitet #eoglo.ina za O2 regulisu organski "os"ati,dok a:nitet ioglo.ina za O2 ne regulisu c!emolobin ima veci anitet za $2 od miolobina d!anitet miolobina i emolobina za $2 ne ovisi od pH e!  i C

@K.+oja je od sljedeci tvrdnji tacna?Hemolobin & *ormira percipitate? a(zato sto valin u pozi+iji % .eta lan+a stvara ljepljive #idro"o.ne povrsine b!koji su reverzibilni prilikom oksienacije +(koji ijenjaju o.lik eritro+ita d(sao u deoksi "ori e!samo kod omoziota

@=.&ta od navedeno predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena? a!smjestena su izmedju dvije beta povrsi unutar 4 domena .( +ine i# petlje "orirane od C04 regija /L i /H doena +(ko"ora+ijski se ijenjaju nakon vezivana antigena ili #aptena dalje se ne vidi

1. Šta od nabrojano predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena ? provjeriti

a! &mjestene su izmedju dvije B povrsi unutar 4 domena

b! Yine i petlje *ormirane od C/R reija 4" i 4/ domena

c! +on*ormacijski se mjenjaju nakon vezanja atiena ili aptena

d! &adrEe aminokiselinske ostatke koji se vezu za antien

e! 9ormiraju mnoobrojne idroenske veze , slabe elektrostatske , van der Zalsove i interakcije sa povrsinom antiena

2.+oja (koje! od sljedeci tvrdnji ukazuje da se emolobin & razlikuje od emolobina  zato sto je lu:tamat zamjenjen sa valinom na poziciji ' B lanca?

a!-orrin koji je izoliran iz emolobina & ima jedan ostatak valina vise od porrina koji je izoliran iz emolobina 

b!&vi tripticki peptidi emolobina & identicni su triptickim peptidima emolobina 

c!edan izmjenjeni peptid u emolobinu & mirira brze pema katodi (#! neo odovarajuci peptid emolobina 

e! Azoelektricna tacka emolobina & malo je niza od izelektricne tacke emolobina 

0. -ovezi odlike miolobina u lijevoj koloni sa njiovim od.osobinama u desnoj koloniJ a!*erimiolobin 1. 9e u 82 oks.stanju

b!oksimiolobin 2.9e u 80 oks.stanju

c!deoksimiolobin 0.$ksien vezan za ' koord. poz.

K.' koordinativna pozicija prazna

=.H2$ vezana za ' koordinat.poziciju

'.Histidin na = koordinat.poziciji

a#2,=,',

b#1,0,',

c#1,K,'.

K.Šta je predstavljeno na slici ?

Na slici je prikazan MHC 1 protein.MHC proteini klase 1 imaju nevarijabilni B lanac (B2 mikrolobulini! i varijabilni "#lanac .$ba su smjestena e%tracelularno.&vaki covjek stvara ' razliciti " lanaca za klasu 1 MHC proteina.)naci da B lanac ne ucestvuje u *ormiranju ipervarijabilno reiona odnosno mjesta za vezivanje antiena. MHC 1 proteini nalaze se na povrsini celija kicmenjaka .+ada stvori peptid dospije u cistol , oni se kombiniraju sa proteinom MHC1 te kao takvi vezu se sa vanjske strane celijske membrane kao sinali za kaskadni proces .

=.Napisi rakciju alanin aminotrans*eraze .+oji koenzim ucestvuje u reakciji? $bjasni njeovu ulou ?

Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin aminotrans*eraze odvija se uz pomoc koenzima piridoksal *os*ata .

-ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezan za enzim , stvaraju  bazu .Mezo.......... , pomakom dvostruke veze i idrolizom dolazi do izdvajanja 2 okso kiseline , a piridoksal *os*at ostaje vezan za enzim.-iridoksalni *os*at dalje reauje sa "#oksolutaratom dajuci  bazu. Nakon pomaka dvostruke veze idrolizom se oslobadja lutamat .

'.Šta je predstavljeno na dijaramu ? $bjasni promjenu kineticki parametara na datoj slici .

/ijaram predstavlja enzimsku kinetiku u prisustvu i bez kompetitivno inibitora . Moze se konstatovati da ezivanje kompetitivno inibitora na aktivno mjesto u enzimu umjesto supstrata dovodi do promjene Micaellsove konstante koja predstavlja odnos supstrata i enzima ( ako je k0 k2! jacine njiovo vezivanja kao i njiovo aniteta , sto je kM manje to se supstrat labavije veze i ima manje aniteta .3 kompetitivnoj inibiciji kM se povecava , 4ma% ostaje nepromjenjeno .)nacajka ovo vida inibicije jeste sto se moze sprijeciti koncentracijama supstrata.

154 6 +m 54ma% 7 15Cs 8 15 4ma%

7 1 5+m odsjecak na apcisu

15Cs odsjecak na ordinatu