Clase 1 Microbiologia Basica y Aplicada a La Minera

May 7, 2019 | Author: JeffMG | Category: Bacteria, Microorganism, Metabolism, Cellular Respiration, Cell (Biology)
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FACULTAD DE RECURSOS DEL MAR-DEPARTAMENTO DE ACUICULTURA

Biotecnología Minera y Lixiviación Microbiana

 .    2    1    0    2    a    z    r    a    p    s    E    o    i    r    a    M  .    o    t    o    F  .    m    n    s    m    0    0    3    3    a  .    m    6    1    n     ó    i    c    a    i    v    i    x    i     l    o    i    B    e     d    a     l    i    P

Dr. Mario Esparza Mantilla Laboratorio de Biominería. Departamento de Acuicultura. Facultad de Recursos del Mar. Mar. Universidad de Antofagasta. Chile. [email protected]

Contenidos del curso Teorico-Práctico

Unidad I: MICROBIOLOGIA BASICA Y APLICADA A LA MINERA

Unidad III. OPERACIONES DE BIOHIDROMETALURGICA Microbiología Bioinformática

Genética Biología Molecular

BIOMINERIA

Bioprocesos

Bio-Hidrometalurgía

UNIDAD II. LIXIVIACION MICROBIANA  A. ferrooxidans ferrooxidans

 A. caldus

FACULTAD DE RECURSOS DEL MAR-DEPARTAMENTO DE ACUICULTURA

Lixiviación Microbiana    D    A    D    I

   N    U    I

“Desde las células microbianas a la obtención industrial de metales” 

MICROBIOLOGIA BASICA Y APLICADA A LA MINERA OBJETIVOS: Entrenar a los estudiantes en técnicas de muestreo, aislamiento, conteo e identificación molecular de microorganismos biolixiviantes. CONTENIDOS: 1. Introducción a la microbiología. Los dominios de la vida. Bacterias, arqueas y eucarias. 2. Cinética de crecimiento microbiano. Parámetros de análisis. 3. Fisiología Microbiana. Metabolismo autótrofo y heterótrofo, nutrientes, demanda de oxígeno, carbono y sustratos energéticos. 4. Muestreo y aislamiento de bacterias, recuento microbiano, caracterización morfológica y cultivos sólidos y líquidos de bacterias y arqueas biolixiviantes. biolixiviantes. 5. Identificación molecular de microorganismos biolixiviantes. Análisis de ADN y marcadores genéticos asociados al metabolismo energético de metales y al metabolismo de carbono.

   D    A    D    I

   N    U    I

 MICROBIOLOGIA BASICA Y APLICADA A LA MINERA

Introducción a la Microbiología    1    e    s    a     l    C

   N    U    I

Cinética de crecimiento microbiano

Fisiología Microbiana Microbiana

 .     )    0    1    0    2     (    s     l    o    c    y    t    i    m    m    a    Z

Muestreo y aislamiento de bacterias    2    e    s    a     l    C

   D    A    D    I

Recuento y caracterización microbiana

Identificación molecular y genómica

MICROBIOLOGIA BASICA Y APLICADA A LA MINERA  Las células microbianas digieren minerales    D    A    D    I

   N    U    I

M2+ Fe2+ Fe3+

 .     )    0    1    0    2     (    s     l    o    c    y    t    i    m    m    a    Z

SO42- +

2H+

S° Sulfuro Metálico (MFeS2) 1. 2.

Comprender como crecen y funciona la células microbiana. Entender el rol de la célula en un ambiente extremo: pH ácido, poco sustrato, metales pesados, etc.

M2+

Bacterias Biolixiviantes 1. ¿Cómo realiza el proceso? 2. ¿Qué elementos biológicos tiene para digerir el mineral? 3. ¿Cómo evade la toxicidad del metal, mecanismos?

Introducción a la Microbiología El origen de los dominios de la vida    D    A    D    I

El 80% de la historia de la tierra fue exclusivamente dominada por vida microbiana.

   N    U    I

LUCA ( Last Universal Common Ancestor)

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Introducción a la Microbiología Los dominios de la vida    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Introducción a la Microbiología Tamaños de los microorganismos Virus

24  – 300 nm

   D    A    D    I

   N    U    I

Bacterias

0.5  – 5 µm

Protozoos

1 – 10 µm

Algas

10 µm a tamaños mas grandes

Hongos (levaduras y mohos)

6 µm a tamaños mas grandes

Introducción a la Microbiología Composición química de las Bacterias    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Introducción a la Microbiología Tipos de Bacterias    D    A    D    I

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Introducción a la Microbiología

   D    A    D    I

   N    U    I

Tipos de Bacterias

Introducción a la Microbiología Estructura de la célula procariota    D    A    D    I

   N    U    I

Introducción a la Microbiología Características de las Bacterias • •

• • • • •



La mayoría tiene pared celular Algunas presentan capsula Presentan cromosoma circular,  ( algunos de forma linear) Algunas presentan plásmidos Algunas presentan Pili o flagelos. Algunas presentan inclusiones intracelulares (Glicógeno; carboxisomas, magnetosomas). Algunas pueden producir esporas.

   D    A    D    I

   N    U    I

Introducción a la Microbiología Estructuras anatómicas de las Bacterias    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Introducción a la Microbiología Clasificación de las Bacterias    D    A    D    I

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Introducción a la Microbiología Gram +

Clasificación de las Bacterias

Gram   D    A    D    I

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Introducción a la Microbiología

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Cinética del crecimiento microbiano Cinética de crecimiento microbiano

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Las bacterias mineras extremo acidófilas presentan un crecimiento poblacional lento ( desde días a semanas) Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Cinética del Crecimiento Microbiano Crecimiento de Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC23270 en 9K+Azufre (control a pH: 1,5)

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   N    U    I

MADIGAN, M., MARTINKO, J. & PARKER, J. (2008). BROCK BIOLOGY OF THE MICROORGANISMS.

Li y cols. (2011). Folia Microbiol 56:439 –451

Cinética del Crecimiento Microbiano Tasa específica de crecimiento (µ) de bacterias



La ecuación que describe el crecimiento, está dada por:

   D    A    D    I

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Ecuación de Mond N: cantidad de bacterias t: Tiempo de incubación µ: Tasa de crecimiento bacteriano

Integrando:

N: Cantidad inicial de bacterias t: Tiempo de generación bacteriana Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Cinética del Crecimiento Microbiano Tasa específica de crecimiento (µ) de bacterias

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Cinética del Crecimiento Microbiano Las bacterias mineras extremo acidófilas presentan las siguientes características

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   N    U    I

1. El habitad presenta escasos nutrientes 2. Condiciones de pH muy ácidas 3. La distribución de la fuente de Carbono y energía es heterogénea 4. Inicio y termino del proceso con escasa densidad celular 5. La disponibilidad de 02 es diferentes para la mayoría de las células 6. Las células no llegan a densidades mayores a 1010/ml 7. El metabolismo predominantes es quimiolitoautótrofo 8. Escasa materia orgánica para biosíntesis celular 9. Alto estrés celular 10. Alta cantidad de metales pesados y iones tóxicos al metabolismo celular bacteriano. 11. Dificultad de manipulación genética

Fisiología Microbiana Las célula biolixiviante Acidithiobacillus ferrooxidans se alimentan de CO 2 y obtienen energía de la oxidación de Fe 2+,S°, tiosulfato, H2 e Uranio.    D    A    D    I

   N    U    I

Esparza y cols., (2009)

Fisiología Microbiana La fijación de carbono en microorganismos quimiolitoautótrofos    D    A    D    I

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Los carboxisomas almacenan CO2 en bacterias quimilitoautótrofas

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Metabolismo de CO 2 y síntesis de compuestos orgánicos en Bacterias autótrofas    D    A    D    I

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Bowien, (1997); Tabita, (2000); Omata y cols, (2000); Cerff, (2001), Romagnoli y tabita, (2007)

Esparza y cols., (2009)

Fisiología Microbiana Metabolismo microbiano    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Metabolismo energético en Bacterias    D    A    D    I

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Bacterias Biolixiviantes

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana La membrana celular bacteriana    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana La membrana celular de bacterias y arqueas    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Anatomía de la membrana Celular Bacteriana

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Bacterias Gram (-)

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Respiración y cadena de energía de las Bacterias    D    A    D    I

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Coenzima Q ( oxidada y reducida)

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Fuentes energéticas para el crecimiento microbiano ( respiración aeróbica) E  (V) 0

Azufre

-0,50

   D    A    D    I

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-0,30

+0,05

Hierro +0,10

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Generación de la Fuerza Motriz Protónica durante la respiración aeróbica de las Bacterias

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana

Cantidad de energía producida por oxidación de donadores de electrones inorgánicos

   D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Metabolismo de H2 en bacterias y producción de material celular    D    A    D    I

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Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Proceso de Oxidación de azufre por bacterias    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Proceso de Oxidación de azufre por bacterias    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Metabolismo del de azufre por bacterias    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Transporte de electrones y conservación de energía en bacterias reductoras del sulfato    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Fuentes energéticas para el crecimiento microbiano ( respiración anaeróbica)

   D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Fisiología microbiana    D    A    D    I

 A. ferrooxidans

S2O32-

°

S

1.5x0.5µm

   N    U    I

3.0x0.25µm

La morfológica de la células lixiviantes depende del sustrato energético 1.2x0.4µm

 A. caldus

°

S

2.4x0.2µm

S2O32-

He, H y cols.(2010). Geomicrobiology Journal (27):707 –713.

Fisiología Microbiana Distribución de Bacterias en partículas de suelo y restos orgánicos    D    A    D    I

   N    U    I

Las Bacterias buscan un soporte inorgánico para formar colonias

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Proceso de Oxidación del Hierro por bacterias    D    A    D    I

   N    U    I

Flujo de electrones durante la oxidación de Fe 2+ por Acidithiobacillus ferrooxidans Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Bacterias oxidantes del Hierro    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Bacterias Biolixiviantes oxidantes del Fe 2+    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Bacterias Biolixiviantes oxidantes del Fe 2+    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Bacterias Biolixiviantes oxidantes del Fe 2+    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Bacterias Biolixiviantes oxidantes del Fe 2+    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

Fisiología Microbiana Avances y modelos de Estudio    D    A    D    I

   N    U    I

El manejo de la fuente de carbono incrementa la biomasa celular

 Acidithiobacillus ferrooxidans en presencia de más cantidad de CO 2 en el medio aumenta su densidad celular La Combe & Luecking. (1990)

Fisiología Microbiana

Avances y modelos de Estudio Resultados en la obtención de oro por  A. ferrooxidans

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Fisiología Microbiana

Avances y modelos de Estudio    D    A    D    I

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Resultados en la obtención de metales por  A. ferrooxidans al incrementar la fuente de carbono

Se demuestra que la bacteria que crece en exceso de CO 2 se aumenta el rendimiento de la biolixiviación, según lo anterior se debería a que hay más biomasa y por ende mayor capacidad lixiviante.

Acevedo y cols. (1998). Biotech.let.20(3): 257-259.

Fisiología Microbiana Metabolismo del arsénico en bacterias    D    A    D    I

   N    U    I

Brock Biology of the Microorganism, 13 ed (2012)

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