BIOL3365 Lab Biotecnología En el laboratorio tuvieron la oportunidad de aprender técnicas bioinformáticas para el análisis de secuencias de DNA y proteína. Se le asignan dos secuencias de proteína que pertenecen a alpha amylasa: Secuencia I MKQQKRLYARLLTLLFALIFLLPHSAAAAANLNGTLMQYFEWYMPNDGQHWKRLQNDSAY LAEHGITAVWIPPAYKGTSQADVGYGAYDLYDLGEFHQKGTVRTKYGTKGELQSAIKSLH SRDINVYGDVVINFKGGADATEDVTAVEVDPADRNRVISGEHRIKAWTHFHFPGRGSTYS DFKWHWYHFDGTDWDESRKLNRIYKFQGKAWDWEVSNENGNYDYLMYADIDYDHPDVAAE IKRWGTWYANELQLDGFRLDAVKHIKFSFLRDWVNHVREKTGKEMFTVAAYFQNDLGALE NYLNKTNFNHSVFDVPLHYQFHAASTQGGGYDMRKLLNSTVVSKHPLKAVTFVDNWLTQP GQSLESTVQTWFKPLAYAFILTRESGYPQVFYGDMYGTKGDSQREIPALKHKIEPILKAR KQYAYGAQHDYFDHHDIVGWTREGDSSVANSGLAALITDGPGGAKRMYVGRQNAGETWHD ITGNRSEPVVINSEGWGEFHVNGGSVSIYVQR Secuencia II MKQQKRLYARLLTLLFALIFLLPHSAAAAANLNGTLMQYFEWYMPNDGQHWKRLQNDSAY LAEHGITAVWIPPAYKGTSQADVGYGAYDLYDLGEFHQKGTVRTKYGTKGELQSPIKSLH SRDINVYGDVVINHKGGADATEDVTAVEVDPADRNRVISGEHRIKAWTHFHFPGRGSTYS DFKWHWYHFDGTDWDESRKLNRIYKFQGKAWDWEVSNENGNYDYLMYADIDYDHPDVAAE IKRWGTWYANELQLDGFRLDAVKHIKFSFLRDWPNHVREKTGKEMFTVAEYWQNDLGALP NYLNKTNFNHSVFDVPLHYPFHAASTQGGGYDMRKLLNSTVVSKHPLKAVTFVDNHDTQP GQSLESTVQTWFKPLAYAFILTRESGYPQVFYGDMYGTKGDSQREIPALKHKIEPILKAR KQYAYGAQHDYFDHHDIVGWTREGDSSVANSGLAALITDGPGGAKRMYVGRQNAGETWHD ITGNRSEPVVINSEGWGEFHVNGGSVSIYVQR Su trabajo es analizar estas secuencias y encontrar cambios en comparación con la secuencia de alpha amylasa que usted identifico en su ejercicio de laboratorio. Breve y claramente conteste las siguientes preguntas: 1) Identifique variaciones en amino ácidos entre la secuencia determinada en el laboratorio y las secuencias I y II. 2) Compare la estructura de alpha amylase determinada en el laboratorio con el modelo estructural de las secuencias I y II. 3) Una vez identificados los cambios en amino ácidos y estructurales, explique como estas sustituciones pudieran afectar: a) estructura secundaria b) estructura terciaria c) función de la proteína
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