Asam Amino

 

Asam am amin ino o ada adala lah h asam asam • Asam karboksilat yang mempunyai gugus amino pada atom C• Asam Asam amino amino pe perta rtama ma dite ditemuk mukan an : asparagin pada tahun 1806, yang terakhir treonin • Asam Asam amino amino pe pembe mbentu ntuk k prote protein in mempunyai konfigurasi L

 

COOH Rumus umum asam amino :

H3N

C

H

R

COOH

COOH H3N

C

H

CH3 L-alanin

H

C

NH3

CH3 D-alanin

 

Penggolongan asam amino berdasarkan gugus R • Gugus R non ppoolar – Alanin, Isole Isoleusin, usin, Leusi Leusin, n, Metionin, Metionin, Fenila Fenilalanin, lanin, Prolin, Triptofan, Valin • Gugu Guguss R po pola lar, r, ti tida dakk b ber ermu muat atan an – Aspar Asparagin, agin, Siste Sistein, in, Gluta Glutamin, min, Glisi Glisin, n, S Serin, erin, treonin, Tirosin • Gugu Guguss R be berm rmua uata tann nneg egat atif if – Asa Asam m aaspa sparta rtat, t, A Asam sam glu glutam tamat at • Gugu Guguss R be berm rmua uata tann ppos osit itif if – Ar Argi gini nin, n, H His isti tidi din, n, L Lis isin in

 

Asam amino esensial dan non esensial • Essensial – Isoleusin – Leusin

• Non esensial – Alanin – Asparagin – Aspartat

– Lysin – Valin – Metioin

– – – –

Glutamat Glutamin Glysin Serin

– Feni Fenila lala lani ninn – Tripto ptofan

– – – –

Prolin Tirosin*) Histidin *) Sistein*)

*) Semiesensial

– Arginin*)

 

Asam amino terionisasi dalam air

• Didala Didalam m larutan larutan asam asam amin amino o dapat dapat bersifat asam atau basa H

H R

C

COO-

NH3+

R

C

COO- + H+

NH2

Ion dipolar/zwitterion Berperan sebagai asam (donor proton)

 

Berperan sebagai basa : aseptor proton H R

C

H COO-

NH3+

+

H+

R

C

COOH

NH3+

Senyawa yang dapat berperan sebagai asam maupun basa: ampoter/ampolit

 

• Elektr Ele ktrofo ofores resis is memisah memisahkan kan asam asam amino berdasarkan muatan

 

Peptida adalah rantai asam amino

Reaksi kondensasi asam amino membentuk ikatan peptida

2 molekul asam amino : dipeptida 3 molekul asam amino : tripeptida 4 molekul asam amino : tetrapeptida, etc >100 asam amino : protein

 

Kebutuhan asam amino esensial

Amino acid

mg per kg body weight

mg per 70 kg

mg per 100 kg

H Histidine

10

700

1000

I Isoleucine

20

1400

2000

L Leucine K Lysine

39 30

2730 2100

3900 3000

M Methionine + C Cysteine

15 (total)

1050

1500

Phenylalani ne + Y Tyrosine

25 (total)

1750

2500

T Threonine

15

1050

1500

W Tryptophan

4

280

400

V Valine

26

1820

2600

F

 

• Protei Proteinn adala adalah h suatu suatu poli polipep peptid tidaa yang yang mempun mempunyai yai BM BM +/11 500 +/ 5000 0 - > 1.0 1.000 00.0 .000 00.. • Sifat Sifat kela kelarut rutan an terg tergant antung ung pad padaa ranta rantaii asam asam amin aminoo pembentuknya (mudah larut dalam air atau tidak larut dalam air • Pro Protei teinn murni; murni; tida tidakk berbau berbau,, tidak tidak ber berasa asa.. Beber Beberapa apa derivat protein berasa pahit • Bersifa fatt ampolit • Menga engala lam mi den denat atur uraasi

 

Penggolongan protein berdasarkan fungsi biologi

• Protein enzim – Ri Ribo bonu nukl klea ease se,, trips tripsin in

• Pr Prot otei einn tr traans nspo port rt

– Hemo Hemoglob globin, in, albu albumin min serum serum,, miog mioglob lobin in

• Pr Prot otei einn kon kontr traakt ktil il – Akt Aktin, in, mio miosin sin,, tubu tubulin lin,, dinei dineinn

• Pr Prot otei einn nut nutri rien entt dan dan pe peny nyim impa pann – Gli Gliadi adin, n, ovalbu ovalbumin min,, kasein, kasein, ferit feritin in

 

• Pr Prot otei einn str struk ukttur uraal – Kerati Keratin, n, fibroi fibroin, n, kolage kolagen, n, elasti elastin, n, proteoglikan

• Pr Prot otei einn per perttah ahan anan an – Antibodi, Antibodi, fibri fibrinoge nogen, n, tromb trombin, in, tokdi tokdinn botulinus, bisa ular, risin

• Protein pe pengatur – Insul Insulin, in, horm hormon, on, korti kortikotro kotropin, pin, repre represor sor

 

Protein sederhana • Protein globular – Ranta Rantaii poli polipept peptida ida berl berlipa ipat-lipa t-lipatt membentuk globular

– La Laru rutt da dala lam m ai airr – Seb Sebagia agiann besar besar memp mempunya unyaii funsgi funsgi gera gerakk • Protein se serabut – Molekul Molekul serabu serabutt panjang panjang,, rantai rantai polip polipepti eptida da memanjang pada satu sumbu – Ti Tida dakk lar larut ut da dala lam m air air – Be Berp rper eran anan an stru strukt ktur ural al

 

Berdasarkan strukturnya • Pr Prot ote ein se sede derrha hana na – Hanya Hanya terdir terdirii atas moleku molekul-mol l-moleku ekull asam asam amino

• Pr Prot otei einn ma maje jemuk muk/g /gab abun unga gann – Protein Protein yang yang mengand mengandung ung gugu guguss non-protei non-proteinn (gugus prostetik) misal : karbohidrat, lipid atau asam nukleat

 

Struktur protein • Struktur pr primer   – Menunjukan jumlah, jumla h, jenis dan urutan asam amino.

 

• St Stru rukt ktu ur se seku kun nde der  r   – Struktur lembaran lembaran berlipat berlipat paralel dan antiparalel, dan struktur alfa heliks  – Disusun oleh oleh ikatan hidrogen hidrogen antara atom H dari gugus N-H dan atom O dari gugus C=O.

 

-sheet

 

• St Strruk uktu turr te terrsie ierr – Menunjuk Menunjukan an kecender kecenderung ungan an polipept polipeptida ida membentuk lipatan atau gulungan – Disusun Disusun oleh oleh ikata ikatann elektrost elektrostatik, atik, ikata ikatann hidrogen, interaksi hidrofob, interaksi dipol-dipol, ikatan disulfida

 

Struktur triosa phospat isomerase

 

• Stru Strukt ktur ur ku kuar arte tene nerr – Mer Merupa upakan kan pers perseku ekutua tuann unitunit protein – Jika unit prote protein in penyusu penyusunn tidak tidak sama: kuartenere heterogen – Oli Oligom gomer er : gabunga gabungann bebera beberapa pa unit protein

 

Structure of human hemoglobin. The protein's α and β subunits are in red and blue, and the iron-containing heme groups in green. From PD PDB B 1G 1GZX ZX Proteopedia Hemoglobin

 

Sifat-sifat umum protein • Protei Proteinn murn murnii tida tidakk berba berbau, u, tid tidak ak ber berasa asa,, beberapa derivat protein berasa pahit • Bersifat am ampoli litt : – Dap Dapat at bersi bersifat fat seba sebagai gai asam asam maup maupun un basa basa • Me Meng ngaala lami mi de dena nattur uras asii • Vi Vissko kossit itaas ter tertten entu tu • Membentuk koloid • Da Dapa patt dikr dikris isttal alis isaasi • Dapat diend ndaapkan

 

• Me Memb mber erik ikan an re reak aksi si wa warn rnaa – Reak Reaksi si bi biur uret et • Menunj Menunjukan ukan adany adanyaa ikatan ikatan pept peptida ida – Re Reak aksi si xa xant ntop opro rote tein in • Posit Positif if untuk prote protein in yang mengand mengandung ung tirosin, tirosin, fenilalanin dan triptofan – Re Reak aksi si mil millo lonn-Na Nase se • Posit Positif if untuk prote protein in yang megad megadung ung tirosin tirosin (positif untuk fenol-fenol) – Reak Reaksi si Hop Hopsk skin in col cole e • Menunj Menunjukan ukan gugus indol dalam prot protein ein – Re Red duk ukssi sul sulfu furr • Menunj Menunjukan ukan adanya adanya gugus gugus sulfida sulfida dalam dalam protein protein