Bioinformatica
DOCENTI DEL CORSO: Dott. Alessandro Paiardini
[email protected] Prof. Stefano Pascarella
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Via degli Apuli 9 Tel. 06/49917700
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Wikipedia
Cos’è la Bioinformatica? La bioinformatica è una disciplina scientifica dedicata alla risoluzione di problemi biologici con metodi informatici
Cos’è la Bioinformatica? “…un indispensabile strumento di lavoro per il biologo moderno” “…una nuova disciplina, che coniuga lo studio del vivente con l’informatica” “…l'insieme degli strumenti informatici, delle relative applicazioni e delle ricerche che possono essere prodotte tramite tali strumenti e tali applicazioni nei diversi settori della biologia e della medicina”
“…è una scienza che utilizzando le metodiche delle Scienze dell’Informazione si occupa del trattamento e dell’analisi dei dati di tipo biologico” “…è una scienza multidisciplinare che integra conoscenze informatiche, chimiche, matematiche, biologiche allo scopo di collezionare ed elaborare sistematicamente ogni informazione per ottenere la massima resa dalle ricerche sperimentali ma anche per sviluppare queste ultime in modo più mirato” “…è lo studio del vivente attraverso gli strumenti propri dell’informatica”
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BIOINFORMATICA:
VITA + INFORMAZIONE!
Che cos’è la vita?
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Che cos’è l’“informazione”? …Mi scusi, devo consegnare un pacco all’Università “La Sapienza”: sa dirmi la strada?
…Certo! Giri alla prima a destra, poi al semaforo a sinistra, e prosegua diritto fino a P.le Aldo Moro
Che cos’è l’“informazione”? …Mi scusi, devo consegnare un pacco all’Università “La Sapienza”: sa dirmi la strada?
Certo! Poi a sinistra, e diritto, a destra prima alla giri, fino a prosegua P.le Aldo Moro
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Informazione: dato + struttura! … l’informazione è sempre strettamente correlata al concetto di “dato”, un osservabile presentato alla conoscenza, e di “struttura”, l’organizzazione ordinata del dato, che ne permette l’apprendimento.
inf or ma ti c a
fisica
La Bioinformatica è una scienza multidisciplinare… a ti c ma e t ma
Bioinformatica ch im ica
biologia
a tic tis a t s
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I 10 problemi principali per i quali un BiologoBiologo-nonnoninformatico si rivolge ad un Bioinformatico… Bioinformatico… 1.
Che cosa fa questo gene/proteina?
2.
Con quali altri geni/proteine è imparentato il mio gene/proteina?
3.
Puoi predire la struttura tridimensionale di questa proteina?
4.
Mi dici con quali altre proteine interagisce la mia proteina?
5.
Quali segnali (promotori, enhancer…) sono presenti nel mio gene?
6.
Quali motivi strutturali sono presenti nella mia proteina?
7.
Quali residui della mia proteina devo mutare per farle acquisire una determinata funzione?
8.
Puoi progettare un inibitore/farmaco di questa proteina?
9.
Puoi scrivermi un programma per analizzare i miei dati?
10. Nel mio computer c’è un Virus!!! AIUTOOO!!!!
Cos’è la Bioinformatica? l'insieme degli strumenti informatici, delle relative applicazioni e delle ricerche che possono essere prodotte tramite tali strumenti e tali applicazioni nei diversi settori della biologia e della medicina.
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Gli strumenti della Bioinformatica… Computer…
Internet…
Reti informatiche…
Dati biologici…
Le applicazioni della Bioinformatica Basi di dati biologici
Reti neurali
Allineamenti di sequenze Analisi e predizione di strutture proteiche
Drug design
Analisi di genomi Alberi filogenetici
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…sempre dalla rete… rete…
“… in un futuro non troppo lontano potremmo essere in grado di costruire e far funzionare una
cellula virtuale (e-cell) in cui progettare e realizzare esperimenti virtuali, con grande risparmio di risorse sia economiche che umane e animali…”
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